从前，在一座美丽的森林里，住着一只叫小灰的兔子。它每天都会去山间采蘑菇。
有一天，天刚蒙蒙亮，小灰就出发了。它走啊走，突然，看到路边有一个山洞，小灰高兴极了，心想：里面肯定会有很多蘑菇的。于是，它就蹦着跳着走进了山洞。刚一进洞，洞门“咚”一下关上了。里面黑漆漆一片，小灰吓得哆嗦起来。
这时，山洞里传出一阵阵嘻嘻哈哈的笑闹声，听起来，非比寻常，但，小灰不害怕了，心想：有笑声肯定会有小动物的，我要进去一探究竟。刚走了几步，小灰就看见一块石碑，上面刻着：巨石撞击。小灰想：呆会儿是不是会有几块巨石滚过来？果然不出所料，小灰周围的巨石剧烈地震动起来，从各个方向向小灰滚来，一下子，就把小灰埋在了石头堆里，小灰一伸手臂，石头又马上散开。小灰撒退就跑，石头又立刻向小灰合拢来，小灰拼命跑。突然，它觉得脚被什么东西绊了一下，仔细一看，原来是它把一条巨蛇给搅醒了。小灰连忙捏住巨蛇的头，三百六十五度大转圈，用它甩向巨石，只听“轰”一声，石头全都碎掉了。这时，它发现在巨石堆里有一枝金光闪闪的神笔，心里十分高兴。他立刻一个箭步上前，取出神笔马上出洞。回到森林后，小灰用神笔帮助小动物们解决了许多难事儿，大家都热情地叫它：“神笔小灰”。